Vào một ngày tháng 12 lạnh giá, Kyon đến trường để chuẩn bị cho một chuyến đi chơi khác cùng các thành viên Lữ đoàn SOS của mình. Tuy nhiên, thật ngạc nhiên, anh phát hiện ra rằng hầu hết mọi thứ đã thay đổi hoàn toàn: Haruhi Suzumiya và Itsuki Koizumi không thấy đâu cả; Mikuru Asahina hoàn toàn không nhận ra anh ta; Yuki Nagato là một con người bình thường; và Ryouko Asakura đã trở lại một cách bí ẩn. Mặc dù không xa lạ gì với thế giới siêu nhiên, Kyon vẫn cảm thấy lo lắng trước diễn biến kỳ lạ này và quyết định tự mình điều tra. Nhận thấy mình là người duy nhất nhận thức được thực tế trước đó, Kyon giờ đây phải đối mặt với một lựa chọn khó khăn: cuối cùng sống một cuộc sống bình thường mà anh luôn mong muốn, hoặc khám phá ra cách quay ngược thời gian và khôi phục lại sự hỗn loạn của mình. nhưng thế giới quen thuộc.